在手下士兵汇报了指月城地穴内的消息后，岛津亿隆也来到明军营帐将消息报告给了朱由棷。
“陛下，地穴里的所有倭寇士兵都已经死了，德川家光和后光明天皇的尸体已经发臭，如今地穴里唯一的幸存者是之前的女天皇明正天皇，我们如今应该怎么处理？”岛津亿隆问道。
朱由棷原本是想看一看这些倭寇的惨状以解自己的恨意，不过听到岛津亿隆描述的洞穴内的情况后，也失去了兴趣道：“你们将后光明天皇的尸首抬出来，找个地方埋葬吧，不过天皇家族的血脉最好不要留下来，那位明正天皇，就让她体面的离去。”
“是陛下。”岛津亿隆回应道。
朱由棷看着岛津亿隆依然踌躇着没走，又问道：“你是在担心岛津光久的事情吗？”
“是的陛下，如今倭寇国已经，我觉得是时候让家主回到这里了，这也是我们岛津家一直期待的。”岛津亿隆回答道。
“好，不过在这之前，我还有几件事情要做，你将王晓良他们喊过来。”朱由棷吩咐道。
王晓良、罗金昌这段时间也一直在等待着指月城的消息，听到岛津亿隆转达的命令后，就立马赶到了营帐。
“大家这段时间都辛苦了，拿下倭寇国很不容易，但现在还有几件事情需要你们完成。”
朱由棷接着说道：“一，是原本计划好的，将季明志等人的身份公布出来，他们也在倭寇岛待
了这么多年，若是愿意留在这里就让他们帮助大明参与管理倭寇国的事情；
二，将天皇和德川家光的死讯传至全倭寇岛，并清剿那些抵抗势力，主要是土佐藩还没有平定，这件事需要你们海军和陆军的配合；
三，实行同化政策，这段时间朱舜水在九州岛做的事情已经初见成效，今后整个倭寇国的事情都由他来主导。
四，季明志提到的倭寇国生活的那些明朝百姓的后人，你们要重视起来，让他们恢复大明百姓的身份。
五，这些藩国的首领都全部押往熊本城，待所有人聚齐之后，我会举行大典，将大明的规矩公布出去。
其余的事情，你们酌情考虑，不明白的再向我汇报。”
朱由棷知道，这些倭寇国人与生俱来的奴性，他准备在离开之前，将倭寇国的事情彻底解决，不留下隐患。
“是陛下。”众人回应道。
倭寇国如今只剩下，国府台城北面的少数藩国和土佐藩这两部分势力没有解决了，将这两部分解决之后，倭寇国所有的战争也都结束了。
出了指挥营帐后，王晓良也是将北边的这些势力的清剿工作交给了岛津亿隆，自己带着一部分精锐的岛津武士和步兵坐上了运兵船，跟着罗金昌的舰队来到了土佐藩的高知城，此时幕府联军的一部分海军还在高知城前不远的浦户港停泊。
待第二日，明军海军舰船大军压境，他们才反应过来。
山内忠义听到明军大军压境的消息，则是举着白旗，乘船来到了明军的舰队中以表诚意，他随身只带了两位家臣，罗金昌也同意了他的要求，在定海号上接见了他。
“大人，我们土佐藩决定归顺大明，还请您将我们的诚意转达给大明陛下。”山内忠义一脸笑意地说道。
实际上罗金昌也对土佐藩的投降，有了心理准备，他们土佐藩的这块领地上没有受到战争的波及，既然天皇已死，山内忠义自然不用再为德川家效忠。
但王晓良和罗金昌来到土佐藩之前，陛下也对土佐藩的投降提出了要求，若是土佐藩投降，必要要撤去步兵及海军的编制，这里只允许大明的军队存在。
“大人这片土地，我们山内家肯定能管好的，请您和大明陛下放心。”
山内忠义自然是抱着侥幸心理的，他的意思也很明显，想要继续接管这块土地。
“你们山内家一直管理着土佐藩，也算是有一定的建树，成为了四强藩之一也证明你们的本事，但如今倭寇国是在大明的治理下，所以土地的领导者也只有一位便是大明陛下。”罗金昌没有留情直接说出了他的想法。
山内忠义听到这句话，则是脸色一黑，但他明白这场战斗无论是打或者不打，他都已经是劣势，或者说已经是注定失败的结局。
山内忠义想了很久，想到了德川家康还有如今德川家及天皇的结局，终于
低下头来，说道：“我们接受明军的安排，土佐藩的士兵也可以由你们来处理，不过我山内家还想继续拥有一定的特权，毕竟我们可不是那些平民百姓。”
山内忠义这段话已经将自己的身份放得很低了，罗金昌也得到过陛下的授意，点头道：“既然如此，山内家主您就暂且留在我们的舰船上，待土佐藩的军队接受了我们的收编之后，我们再放您回去，这样我也好向陛下交代。”
身边的山内家家臣都有心劝家主，不要冒险这么做，但山内忠义也却已经做了决定，他点头接着说道：“那就谨遵罗司令的处置，这是我的令牌，山内家的军队任罗司令处置。”
“好。”
罗金昌点点头，接过了山内忠义的令牌，这样的结果自然是最好不过了。
有了山内忠义的配合，土佐藩的清理也仅仅花费了两天的时间，其中原本的德川幕府联军，在罗金昌与王晓良汇合后，将这些人押往了九州岛。
这些人虽然没有直接与明军战斗，但他们的身份依然很尴尬，在九州岛只能以奴隶生存下去，当然王晓良不会直接告诉他们的命运，这一切都会交给岛津家来安排，而土佐藩手中原本的士兵则被归为了仆从军，这些人也被送到了九州岛，不过他们的命运就好多了，只需要经过明军的训练之后，就能恢复士兵的身份，而山内忠义本人则送往了熊本城，等待
陛下的巡视。
明军队伍也将朱由棷将在熊本城商议倭寇国未来事宜告知了倭寇国各藩的藩主以及各个城池的城主，他们得到消息后也第一时间赶往了熊本城，他们也一直担心着倭寇国的未来，也想知道这位大明陛下是怎么决定的。