《黑暗笔录》故事应该是这样的：
阮素琳的父亲早年就走了，后来阮素琳的母亲与一个男人组成了一个新家。
但是阮素琳对继父的评价如下：在我心里，他就是一个白痴、无脑、鲁莽的混合体，我打算他死后卖掉房子去纽约，离开这个梦魔般的地方。
而就在这时，约翰出现了，他约了阮素琳许多次，她一直没有答应，但是因为家里压力太大，便答应了，第一次约，阮素琳就觉得约翰，十分的温柔，又很幽默，用她自己的话，就是：那是我人生中最开心的夜晚。并且约好了下次时间，但是不想让家人知道。
可是阮素琳的父母还是知道了，他们不喜欢约翰，但是阮素琳已决定非他不嫁。
阮素琳母亲去世后第二年，医院传来了阮素琳继父病危的消息，但阮素琳根本不在乎继父。
阮素琳决定继父死后卖了他的房子，并到纽约去。
因为她很想登上百老汇。
后来她与约翰组成了一家，并生下兄妹俩，哥哥叫山姆，妹妹叫格温妮丝。
后来，阮素琳成功登上了百老汇，可是约翰被查出了肝癌。在又一次检查后，发现有一定概率可以治疗，约翰很开心。
可是有一天，约翰发现了阮素琳撕了的日记碎条，但是排错了顺序，以为阮素琳出轨了，孩子不是自己的，而且打算他死后卖了房子去纽约。
约翰无法接受，从此变了，变得暴躁易怒，并且常躲在房间里不知道在干什么，孩子不小心弄坏了他的东西，就要打孩子，阮素琳被约翰的举动吓坏了，找了个新房想躲开他。
而约翰在这期间发现了一个恶魔笔记，里面有献祭便可以让恶魔完成一个愿望的方法，以及夺取他人灵魂获得生命力的方法，于是约翰挖开浴室下方，发现了恶魔祭祀台，决定以一家人为代价召唤恶魔，约翰便去抓家里人，山姆发现了异常，为保护妹妹，骗妹妹玩捉迷藏，在要被发现时，山姆冲了出去，保护了妹妹，自己和阮素玲被约翰捉走献祭。
但是仪式失败了，山姆和阮素琳成为了鬼魂，约翰被仪式反噬，边逃边寻求帮助。
李斯特不知道为何手上有了一个恶魔符号和仅剩十年的诅咒，看电视时见大门上有恶魔符号，于是去幸福商城调查。
此时，李斯特正好路过，约翰刚要求助，便被恶魔附体，李斯特用栅栏门挡住了恶魔，却被困在体育用品店内，李斯特准备在笔记上写遗言时，笔记上突然有文字告知有暗门，便从暗门逃到了约翰一家的房间，李斯特很高兴，但文字告诉李斯特他在2010年10月17日失踪了，李斯特告诉文字现在就是这天，可文字却说现在是2020年。
李斯特很奇怪，但是还是决定先找到离开这里的办法。
十年后的某一天，卡洛琳收到了二手店老板赫尔墨斯的消息，来到了幸福商城，购买了老者赫尔墨斯儿子的一些藏书，其中有一本恶魔笔记，卡洛琳碰到后手上出现了恶魔符号，到厕所想办法时书上突然出现了字迹，还说自己是十年前的人，准备离开却传来男孩的哭声。
原来山姆成为鬼魂后继续保护妹妹，并让妹妹沉睡，虽然心里还是善良的，但是他还是个小孩，喜欢玩，所以喜欢捉弄别人，造成了商城闹鬼，男孩就是山姆，虽然喜欢捉弄人，但只要给玩具就会放过了，可是卡洛琳此时没有玩具，便向李斯特求助，果然拿到了玩具并成功离开了厕所。
此时的卡琳相信这个笔记本可以跨时空对话，并提醒李斯特他会在这天失踪。
李斯特认为自己失踪是因为之前被假人追杀，自己进入暗门，时间线已经改了。
卡洛琳则向他问起了恶魔符号的问题，而李斯特正是为了破解恶魔符号的诅咒而来。
卡洛琳准备离开餐厅，可山姆贪玩仍然缠着她，她便向李斯特求助，并且她已经在二手店买来的书上找到了净化鬼魂的仪式，并告诉李斯特。
李斯特为逃避约翰进了卧室，多次碰到红衣鬼魂阮素琳，阮素琳给了李斯特一些纸条让他知道真相，并打碎镜子引来约翰，迫使李斯特躲在床下，找到约翰的恶魔书，，而在李斯特快被约翰发现时，让黑猫罗宾引开了约翰，而李斯特从书上知道了三个阵法线索。
此时的卡洛琳求助李斯特让山姆离开，李斯特便趁机摆阵，此时约翰来了，李斯特边用强光击退约翰边念咒，成功得到了约翰的信物，在约翰虚弱之时，李斯特净化了山姆，而山姆则让李斯特知道了通向恶魔祭坛的路。
卡洛琳发现山姆不见，表示感谢时，李斯特告诉了卡洛琳山姆与阮素琳变鬼真相，二人决定再净化阮素琳。
卡洛琳净化了阮素琳，阮素琳最后还帮卡洛琳拿了一个锥子，让其消灭商城假人恶魔的附身，卡洛琳正要出去，不料商城被封死了。
原来，李斯特在救格温妮丝时搞错了仪式，让格温妮丝成为了恶魔，于是李斯特想办法救，卡洛琳则去寻找出口。
卡洛琳想开一个箱子时被一只幽灵猫阻止，于是两人开始找猫条，李斯特用棒球代替，为了让卡洛琳拿到，将其放入柜子并打开门。
卡洛琳进了神秘学商店，却发现了被封印的格温妮丝，于是想办法救她，吸引猫离开后，找到了权杖，并根据哭泣天使手的线索找到了红宝石，不料假人堆成为了恶魔之眼，击败它后卡洛琳知道了格温妮丝成为了恶魔，并且告诉了卡斯特。
卡斯特知道后决定献祭自己的灵魂回到半小时前救回格温妮丝，不料这样会失去半小时前之后的记忆，李斯特赶紧告诉了卡洛琳。
卡洛琳这边，格温妮丝破了封印，卡洛琳消灭了边上的小鬼后发现了净化恶魔的仪式，并赶紧告诉李斯特，李斯特净化了恶魔，救出了格温妮丝，但是自己被永眠地下祭坛。
之后，一切恢复了正常，卡洛琳的恶魔符号与笔记也消失了。
卡洛琳没找到格温妮丝，只知道她后来被一对夫妇收养，去了英国。
五十年后，本市又发生了一起重大事件，警方在现场发现了笔记，佩吉便来问卡洛琳，卡洛琳便讲了这个故事。
佩吉走后，小时候向格温妮丝求婚的托比出现了，并且说：“数量够了。”
原来，卡洛琳是格温妮丝，她又许了一个愿望，希望回到六岁，并且知道回去会失去记忆，于是她谎称笔记已经消失，但其实她故意放在了事件现场，目的是让别人记下这些事。
故事梳理完毕，很明显，留下了许多问题，但是答案是什么？
要不要再喝一杯茶？
…………
格温妮丝编了一个亦真亦假的童话，而她的计划，没有结束。