四天前，御坂美琴在街头偶遇了和她长相一模一样的“御坂10001号”，对方头上戴着夜视仪。
如果有一天，你在街上发现了自己的克隆人，你会怎么做？
御坂美琴想不通，为什么她们会被制造出来，她开始对宛如镜中的另一个自己旁敲侧击，迫切想搞清楚这一切的来龙去脉。
可惜她无法弄清“御坂10001号”说出的那串数字的真正含义，反倒和对方愉快地度过了一个下午，两人逛了第七学区一小圈，平常御坂美琴只会一人偷偷去书店蹭免费的漫画书，这次是两人一起去。
御坂美琴不遗余力地向“妹妹”安利她喜欢的漫画书，谁知她并不领情，唯一与自己相同的爱好是呱太。
当御坂美琴从包里取出她心爱的呱太徽章时，“御坂10001号”的表情亮了，她目不转睛地瞧着呱太徽章，原本面瘫的脸瞬间带上了痴迷的神色。
迫于妹妹的“压力”，御坂美琴不舍地把徽章交给她。
“好好珍惜，别弄坏了啊。”
“这是姐姐大人送给御坂的第一件礼物，御坂御坂一定好好保管。”
不知不觉，我已经把对方当成自己真正的妹妹了吗？
两人告别后，她暗中跟着“御坂10001号”，见到了身处废弃矿场的一方通行。
“御坂10001号”射出的子弹，被反射到她自己的身上，一方通行无聊地耸了耸肩，发动能力，地上的一根钢管只是被他的脚轻轻一点，就径直飞向受伤倒地的“御坂10001号”。
御坂美琴发动能力，用电磁力牵引着那根钢管改变轨迹，她愤怒地瞪着那个企图杀害她妹妹的危险分子。
“又一个实验品，不，这个是本尊吗？本大爷对你的命不感兴趣，滚一边去吧。”
她紧紧捏着衣兜里的游戏币，那是她今天和妹妹一起去游戏大厅娱乐剩下的。
省去了弹起游戏币的步骤，超电磁炮以最快速度击发出去。
游戏币就会因为过快的速度在空气中过度磨损，最后在50米开外的空气中被消磨殆尽，所以超电磁炮的有效射程为50米。
一方通行覆盖全身的“自动弹反无形装甲”自动将硬币反射回去，一声尖锐的脆响后，游戏币在空中消散，只剩一道转瞬即逝的橘红光芒。
御坂美琴见一击不成，再用变化的交流电操控磁场，进而吸引地面上的铁砂。
黑色的风暴让大地都微微颤抖，它毫不留情地冲向一方通行，对方看似漫不经心地抬起一只手，触碰到这飞速旋转的铁砂龙卷，轻松将危机化解。
一方通行抬起的手，完好无损，他全身也没有沾染哪怕一丝一毫的铁砂。
御坂美琴没有气馁，她已经酝酿好了她最强的招式。
天空中一道白光将学园都市照亮，这里仿佛毫无过渡一般直接从黑夜转为白昼。
光亮仅仅持续了一两秒，轰隆隆的雷声砸向地面，刺激着人们的耳膜。
一道闪电认准了一方通行，朝着她所在的位置劈了下来。
作为一种直流电，闪电电压为3～200百万V，电流为2000～3000A，与普遍观点不同的是，被闪电击中并不等于被判死刑。事实上，米粒坚国内90%的受害者均存活下来。
但是，在被闪电击中的受害者中，几乎没有人能够毫发无损地跑开，而且电击造成的伤害有可能是永久性的。
这些伤害包括极强的光透过眼睛的视网膜，引发数日乃至数周的白内障，瞬间的高温会使人身上的金属变形，身体表面的汗水迅速蒸发，造成烧伤，闪电带有10-100亿焦耳的电量进入人体后，可能会引发心脏骤停、癫痫、大脑损伤、脊髓损伤，甚至是失忆症。
除此之外，当事人周边的空气会因温度上升而急剧膨胀，形成威力巨大的冲击波。
对于一方通行而言，上述问题都不存在。
御坂美琴不得不捂住眼睛，电光亮度太大了，等到她把手拿开，一方通行早已了结了“御坂10001号”，她的心脏被刺穿了。
临死前，她还死死攥住那枚御坂美琴赠送的徽章。
御坂美琴跌坐在地上。
没有办法阻止实验了吗？
当她质问一方通行为什么要参加这场实验时，对方的回答居然是不甘于同其他Lv5为伍。
其她的“御坂妹妹”来到现场，劝说她不要干涉实验，她的这些克隆人，在未来，也会被眼前这个无法打倒的敌人……
把星野前辈送到医院后，御坂美琴记不清自己是怎么回到宿舍的，梦里，她明白了自己的DNA是如何被这些反人类的研究人员获得的。
房间内，一个少年颤抖着扶着墙壁缓缓站起，没走几步又倒下了。
窗外，一个医生和一个小女孩关注着这一切，小女孩看到少年站起来开心地鼓起了掌，当少年无力地跌倒时紧张地看着他，生怕他再出什么意外。
“他患了肌肉萎缩症，以后一辈子都无法凭借自己的力量站起来了。”医生语气平静，他已经见惯了这类患者，所以心情没有太大波动。
小女孩听着，担忧起病人的未来，她毕竟是第一次了解到这世间还有如此不幸。
“不过，以后说不定会有治疗他的方法，御坂小朋友愿意帮忙吗？”
她闻言，惊喜地点点头。
“只要你提供一小管自己的血液，我们的研究工作就可以开始。”
御坂美琴坚定地点头，跟着医生离开了。
……
风纪委员177支部的电脑高手—初春饰利帮她破解了之前“御坂10001号”说出的一大串数字，御坂美琴通过破解出的网址看到了研究者们事先编造好的看上去十分普通的实验计划。
不，不是这样的。
她定了定神，看到实验内容底部的参与单位。
把这些研究机构的设施全都破坏掉，不就能阻止实验了？
之后几天，御坂美琴换上便装隐藏身份，在黑夜中先用自己的能力使监视器报废，再入侵相关研究所，尽可能将其中的设施全部破坏掉，如此三天后，她的行动终于引起研究人员的重视，一名研究所的负责人花重金雇佣了麦野沈利及其手下保护研究所。